광복 이후 일제에 의해 해산된 성결교 재건과 무교동 교회, 아현교회 등이 주도한 100교회 세우기 운동의 열매로 본 교회가 세워졌다.

무교동 교회(현 중앙교회)김영구, 박흥국장로가 후암동 서편 감나무 동산 김봉자 집사의 2층 다다미 방에서 후암동에 거주하는 무교동교회, 아현교회, 청파교회에 다니던 몇 분 성도들을 모아 박현명 목사를 모시고 개척 예배를 드림

김영구 장로 서울신학교 전수과 입학 후 전담 교역자로 취임, 이후 목사 안수 후 본 교회 제1대 담임목사가 됨

현 위치의 주택 2동을 구입함. 교회(대지 58평, 건물 24평)와 교역자 주택(대지 38평, 건물 13평)을 마련함

경기도 여주군 하자포 교회를 첫 지교회로 설립함

계전리 교회를 동란 중에서도 지교회로 설립함

조기함목사가 제2대 담임목사로 취임

36평의 아담한 성전을 완공하여 봉헌함

오이홍목사, 제 3대 담임목사로 취임(조기함목사, 금옥교회 개척 및 사임)

새성전 상하 각 60평의 교회당을 완공하여 입당함

김성호 담임목사, 제4대 담임목사로 취임

(오이홍목사, 모래내교회 개척 및 사임)

경기도 포천군에 임야 1,000평을 교회 묘지로 구임

조인정장로께서 고향의 복음화를 위하여, 신안군 지도면 장고리에 단독으로 장고리교회를 건축하여 봉헌함

평신도 선교교회 개척 (이동섭목사)

유종길 목사, 제5대 담임목사로 취임

(김성호목사, 총회선교 교육위원장으로 취임 및 사임)

산샘교회개척(김경수목사)

옥합선교교회 개척(김재운목사)

창립50주년 기념교회로 탄현백합교회 개척(김영교목사)

시흥백합교회 개척(양명석목사)

임직자 기념교회로 서울백합교회 개척(박현규목사)

광주백합교회 개척(박영기목사)

이갑렙 선교사를 태국 선교사로 파견

김세진목사, 제6대 담임목사로 취임

(유종길목사, 김해제일교회 담임목사로청빙 및 본교 사임)

후암동 105-89 구입하여 백합선교관 건축 및 봉헌

후암동 105-48, 105-104(81평)를 교역자 사택으로 구입

구 교육관 건물 철거 및 2층 120평의 소망관 건물로 신축 및 봉헌

정순애B 권사 삼안리치 기증(한강대로 102다길 26 401호)

후암동 105-100(26.75평) 구입(비전관)

이갈렙 선교사를 L국 선교사로 파송

창립 60주년 기념교회로 솟아나는 샘물교회 개척(박상철 전도사)

창립 60주년 기념 백합어린이도서관 개관

본관 및 교육관 리모델링

전종철 선교사를 우루과이 선교사로 파송

윤이삭 선교사를 V국 선교사로 파송 (교동협의회 연합)

본관 엘리베이터 설치 및 로뎀 쉼터 개장

창립 70 주년 감사예배

김대영 선교사를 필리핀 선교사로 파송